在拍摄时，巴西寨卡灾情严重，里约热内卢更是重灾区之一，为此，剧组下大工夫，做足预防措施。由于病毒主要传播媒体是蚊子，所以剧组分别在开工前一天和开工前一小时，于外景场地进行大规模灭蚊工作，让剧组可以安心工作。除此之外，在出发去巴西前，主演们也会做足准备，事前打疫苗以备无患。

　　在《使徒行者》这部男人戏中，佘诗曼所饰演的“钉姐”无疑是“万绿丛中一点红”，当有人问起“拍摄中的最大挑战”时，阿佘自曝为了拍摄打戏曾引发颈椎旧伤，敬业而拼命，当粉丝问起她与钉姐性格的相似点时，阿佘笑着表示：“我很乐观，也很喜欢帅哥，但没有钉姐那么贪钱”。

　　在里约20多天的拍摄期内，除了跟黑帮火拼擦身而过，寨卡病毒、高温天气、蚊虫肆虐，也让主创们吃了不少苦头，电影《使徒行者》剧组工作人员和主演张家辉、古天乐经历了一场真实的巴西惊魂记。