为保证电视剧的品质、真实还原当代中国海军潜艇官兵的训练战斗与情感生活，《深海利剑》自2016年10月开拍以来，辗转大连、青岛、武汉、三亚等地取景拍摄。

　　全剧组300多人，无论导演、演员和工作人员都是全程跟随，从冬走到夏，每天坚持高强度的实拍。

　　拍摄期间，赵宝刚导演也克服潜艇内部狭窄、缺氧等艰苦的拍摄条件，亲自深入潜艇内部实景拍摄。

　　剧中一些惊险场景的海浪则是耗时三个月精细制作的特技，大量的深海作战，鱼雷作战，潜艇对战等等，都需要用电脑特技后期制作完成，特技使用量相当大。对此，赵宝刚自嘲“太不知死”。