《海上牧云记》作为一部古装魔幻大剧，减速了端朝末年，牧云皇族和穆如世家三百年的盟约因为一个预言而冰裂。预言说，六皇子牧云笙(黄轩)执剑则天下大乱，而穆如寒江(窦骁)将成为未来的皇帝。以牧云栾(王千源)和牧云德(张晓晨饰)为代表的地方势力密谋趁机夺权，为此不惜与邪恶势力合作。