时至唐穆宗长庆二年(822)，高僧王枚玉因在当地见到山涧石洞间藏有诸多骨骸陶瓮(据当地老辈人口碑相传，这些是当年陈政陈元光奉命赴闽平乱开漳活动时在这里的一场恶战中罹难的唐军将士骨骸)。出于出家人的恻隐之心，高僧王枚玉把这些骨骸陶瓮收集起来，于石门岩寺左前方山坡上集中安葬，并以其博大胸怀在石门寺庙里地藏王菩萨雕像前竖起一块小石碑，上刻“大众爷公”四字，让这些在开发漳州的征战中死难的唐军“大众爷”共享信众朝拜地藏王菩萨的香火。致使如今大多信众竟误把地藏王当为“大众爷公”。延至清嘉庆十八年初冬，由于村民在许多石洞中又陆续发现许多尚未收殓的骨骸，于是乡贤筹资在原来王枚玉所造之“大众爷墓”旁边再造一处新的“大众爷墓”，并在墓前镌刻“同归所”墓碑，该墓碑与所立时间碑文至今犹存。话说回来，高僧王枚玉在建寺葬骸的同时，还募资鸠工辟洞修径、凿池栽荷、植梅插竹、铺路造桥，建亭筑阁，把庙宇四周治理成善男信女在朝拜之后可以舒心游览歇息的风景名胜，至今留下诸多唐代胜迹。唐宣宗大中六年(852)三月十五日，高僧禅苑圆寂于石门岩寺，享年91岁。其中在石门岩创建寺庙、整治环境、传经布道、治病救人、扶贫济困、广施善行达47年之久。当地村民为纪念他，怀念他的建寺以及开发这片山区的功德，便在景点“石门”后侧为他建坟墓，并竖上“开山祖师”的石刻墓碑，还塑像配祀于庙中地藏王菩萨旁边，供人们祭拜。

　　石门寺虽地处深山之中，交通不便，但因其有诸多灵异传说故事，加上遍布山上的奇石和深幽的洞穴等天然景观，名气不胫而走，引得许多文人墨客不顾山路崎岖攀岩越岭前来造访。据《石门岩志》载，宋代理学家朱熹在知漳期间曾到鹅髻山讲学，之后曾慕名到石门寺游览，南靖奎洋人、清代大数学家庄亨阳曾在寺后“听泉”景点边结庐求学，南靖龙山人、清康熙学士吴铎也多次到石门寺朝圣，并留下多篇诗赋。