秦二世三年(前207年)，冬天，赵高做了丞相，朝政专权，谗害忠良。因秦军的退却，二世派人责让章邯。章邯恐惧，派长史司马欣去请示。司马欣到了咸阳，留在司马门三天，赵高不接见，有不信任之意。长史司马欣心里害怕，急忙逃回军中。他怕有人来追杀，没有敢走原路。赵高果然派人追赶他，没有追上。司马欣到了军中，向章邯报告说：“赵高居中用事，下面的人不可能有所作为。如今仗能打赢，赵高必定嫉妒我们的功劳；仗打不赢，免不了被处死。希望将军深思熟虑。”陈余也送给章邯一封信说：“白起为秦将，向南攻拔鄢、郢，向北坑杀马服，攻城略地，不可胜数，而最后竟然赐死。蒙恬为秦将，北逐匈奴，开辟榆中几千里的地域，最终竟然斩于阳周。为什么呢 功劳太多，秦不能按功行封，因此罗织罪名，用国法杀死他们。现在将军为秦将三年了，所损失的士卒以十万计，而诸侯军同时并起，越来越多。那个赵高一向谄谀，为时己久，眼下形势危急，也怕二世杀他，所以打算用法杀死将军，借以推卸责任，另外派人替代将军，以此来摆脱祸患。将军在外时日已久，朝廷中很多人与你有隔阂，有功也是被杀，无功也是被杀。况且天要亡秦，无论是愚笨的人还是聪明的人全都知道。如今将军在内不能直言规谏，在外为即将灭亡的国家的将领，孓然孤立而想长期存在，岂不可哀！将军何不倒戈与各路诸侯联合，签订和约，共同攻秦，割地为王，南向而坐，称孤道寡；这同自己伏砧受戮，妻子被杀，哪个比较好一些呢 ”章邯犹豫不决，暗中派军候始成到项羽营中，想要签署和约。和约没有商妥，项羽让蒲将军昼夜领兵渡过三户津，扎营漳水南岸，与秦军交战，又一次打败了秦军。项羽率领全军士卒在污水上攻击秦军，把秦军打得大败。

章邯派人去见项羽，打算订立和约。项羽召集军吏商量说：“军中粮少，想允许他签订和约。”军吏都说：“好。”项羽就与章邯订期在桓水南岸殷墟相见。已经缔结了盟约，章邯见到项羽，涕泪交下，向项羽诉说赵高的种种行径。项羽就立章邯为雍王，安置在楚军营中，使长史司马欣为上将军，率领秦军为先行部队。

赵高杀死了二世胡亥，立三世子婴做皇帝。子婴做了四十六天秦王，楚军打垮了秦军，进人武关。子婴就用丝带系着脖子，白马素车，捧着天子的印玺和符节，在轵道旁投降。秦朝灭亡。秦朝最后灭亡了，过了五年后，汉朝才统一了全国。

项羽为诸侯联军的领袖，杀死了子婴和秦公子的宗族。屠毁咸阳，焚烧宫室，俘虏了秦国子弟和妇女，把珍宝财物搜刮在一起，诸侯们共同瓜分了。项羽为西楚霸王，负责分封天下诸侯王，消灭了秦国以后，把它的土地分为三部分，封立三个王，名叫雍王、塞王、翟王，号称三秦。

封章邯为雍王，称王于咸阳以西，建都废丘(今陕西省兴平县东南)。长史司马欣，从前做栎阳狱掾，曾对项梁有过恩德；都尉董翳，最初劝说章邯降楚。所以封司马欣为塞王；称王于咸阳以东到黄河一带，建都栎阳；封董翳为翟王，称王于上郡，建都高奴。

汉王元年(前206年)八月，汉王刘邦用韩信的计策，从古道回军，袭击雍王章邯。章邯在陈仓迎击汉军，雍王兵败，退保废丘。汉王随即平定了雍地，向东到达咸阳，率军围困雍王于废丘。

刘邦久攻废丘不下，至汉王二年(公元前205年)六月，被刘邦大将韩信用计水淹城池而城破，章邯遂拔剑自刎。

章邯有二弟，一谓章平，章愍次子；一谓章豨，章愍三子。章平乃我族始祖，亦为秦末将军。随兄章邯降楚后，仕楚为上卿，领兵守武关。刘邦围攻废丘，章邯命其弟章平支援，章平被韩信大败而被俘。后迁居豫章洪州(今江西省南昌市)。

章平生一子章直，汉朝巴东将军。章直生一子章宜，世居豫章洪州。