该片的背景设置在20世纪八九十年代，故事将聚焦凤凰女琴·葛蕾的内在人格被释放后黑化为暗黑凤凰，并与X战警开战的故事。

　　黑凤凰，具有强大物质控制能力，能从微观世界控制任何物体。由于琴葛蕾对自己力量的恐惧而逐渐形成的第二个人格，欧米伽级变种人。

　　在X学院的学生时代，X教授制造了“心灵牢笼”将“黑凤凰”锁住。直至琴的人格陷入沉睡，“黑凤凰”终于冲破牢笼飞出。其性格与琴完全相反。充满了对欲望、暴力的渴望，可释放凤凰状冲击波。