《原生之罪》中的未解之谜有池雯是谁杀的?陆子鸣为什么杀人?陆子鸣真的是凶手吗?董局为什么要杀陆离?池震死了吗?虽然《原生之罪》已经结局，但剧中这些困扰着观众的谜团并未在结局中给出答案。

从一开始，池雯的死便一直让人好奇不已，本以为最后会得知真相，没想到在结局中没有交代当年那件事的前因后果，围绕在池雯、陆子鸣身上的重重谜团也就此成为不解之谜。

结局中，董局终于暴露了他的真面目，作为幕后大boss，张局、楚刀的死都和他有关，对董局来说，陆离根本威胁不到他的地位，而且有陆离在，还能让警局的破案率节节高升，无论从哪方面看董局都没理由杀陆离，但他却曾暗中派池震去杀害陆离，池震下不了手，此事也就不了了之。

池震在结局时被人捅了几刀，倒在血泊中，一年后，成为副局长的陆离拿着池震的酒壶陷入沉思，让人好奇池震究竟是死是活，池震和陆离这对搭档，从相互敌对到成为好兄弟，他们一起经历了很多，池震这模棱两可的结局，也让观众猜测不断。