庙堂之高的兄弟之争、战火纷飞中的异族争斗也推进了剧情走向，霍建华饰演的英宗睿皇帝朱祁镇与黄轩饰演的代宗景皇帝朱祁钰，在面对内忧外患形势中展现出来的兄弟之情和王位之争让该剧颇具看点。再加上袁文康饰演的明朝敬顺王，大元天圣大可汗，瓦剌部首领绰罗斯·也先也加入到民族争斗中，战争戏也是颇为紧张。战争戏份不仅全部在大草原实景拍摄，千军万马的大场面也没有运用CGI技术，而是调动了近千名的群众演员，充分展现了明代的政治、文化、军事风貌。

　　《女医明妃传》中古代医学贯穿始终，编剧张巍不仅请教了多位中医专家，坚持做到“所有的方子都从明以前的医书上摘得。”且涉及方面不仅是治疗，更有养生古方和美容古方等实用性古方流传，张巍更透露每一集末都会有一个美容减肥的偏方。

　　除了弘扬传统医学，刘诗诗饰演的谭允贤在剧中上演了一出“明妃升职记”，让该剧有些中国版“大长今”意味。制片人黄澜对此直言：“《女医明妃传》就是向《大长今》致敬。”