这是关于深化增值税改革中的留底退税问题。以下来说一说。

关于怎么计算，是有一段背景故事的。了解了这个背景，或许对理解怎么计算，有些许帮助。

1. 关于留底退税的规定。

对于企业来说，有留底的税款，很可能是发生了采购，但是相应的销售并未产生，那么进项对于企业来说，就是一种资金的占用。如果企业长期存在大量留底税额，相当于是在为这笔资金“付息”。因此，国家在2018年6月出台了2018年70号文，允许部分行业退还增值税留抵税额。但是，问题随之而来，申请退税后，后续产生的应缴纳增值税，因为没有留抵了，就需要缴纳城建税等附加，而如果纳税人没有申请退还呢，其对应的销项税额无需缴纳增值税，也无需缴纳城建税等附加税费，这么看来，退税后会产生附加税费的问题。所以，国家紧接着出台了一个补充政策，来解决这个问题，这就是2018年80号文。

这个文件说了，

对实行增值税期末留抵退税的纳税人，允许其从城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加的计税（征）依据中扣除退还的增值税税额。

什么意思？比如本期应纳增值税税额为50万，上期留抵为30万。如果申请了这30万退税，那么本期应缴纳的增值税为50万，但是计算城建税的依据不是50万，而是要把这个退税的30万给扣除，因此城建税及附加为（50-30）*（7%+3%+2%）=2.4万，而不是用50*（7%+3%+2%）=6万。

这一政策的出台，让纳税人能够充分享受到税收政策的利好和优惠。

2. 留抵退税的不断深化改革。

今年，在去年的基础之上，又推出了2019年39号文，将退税的范围扩大到了所有行业。当然，这其中也增加了一些限制，比如连续6个月增量留抵额大于零，第六个月增量留抵税额不低于50万元等。一方面，是对于那些常态化有留抵的纳税人，给与税收的优惠，一方面，也减轻纳税人的办税负担。

因此，对于纳税人来说，搞清楚税收的政策，才能更好地运用于企业的实践当中，给企业带来更多的实惠。