朱国志任江苏巡抚期间，大肆搜刮民脂民膏，亲手制造了清初三案：“奏销案”“哭庙案”和“海通案”，杀了很多人，著名文学批评家金圣叹就是他杀的，由于冤杀的人太多，激起了很大民怨。

但是，朱国志制造的三大案件，非常符合朝廷的意思，康熙出于保护朱国志的目的，准备把他换个地方，调他去云南当巡抚。朱国志在江苏作孽太多，民愤太大，他怕有人趁他即将离任之际对自己下黑手，接替他的官员还没到，他就提前溜了。

朱国志擅离职守，朝廷商议，将他连降五级，革职为民。

朱国志虽然贪腐，但他是个典型的酷吏，够狠，也够忠，正是康熙所急需的人才，所以康熙不久又恢复他的职务，把他调到云南当巡抚，让他节制吴三桂。

朱国志到了云南，依然本性不改，因索贿造成士兵哗变，后来他改变方法，不直接索贿，而是向下属摊派，明码标价。由于搜刮太甚，民怨沸腾。

吴三桂胁迫朱国志一起造反时，他不干，在杀了自己的儿女，逼死自己的妻子后，和吴三桂的叛军拼命，被士兵杀死，分吃了他的肉，最后尸骨无存。

云南百姓恨透了朱国志，他死了当地人弹冠相庆。吴三桂借此宣传百姓，大清用这样的官员，来坑害百姓，以此来证明他造反的正当性。

三藩之乱，除朱国志外，殉难者还有按察使李兴元、云南知府高显辰、云贵总督甘文焜、广西巡抚马雄镇等等。

朝廷对殉难者都给予了褒奖，朱国志因为名声太差，这是事实，吴三桂又利用他做文章，褒奖他对朝廷不利，所以康熙暂避风头。

不管怎么说，朱国志是为大清殉难，所以最终清廷还是把他列入《忠义传》。