企业长期缺少成本费用发票，那么可能会导致企业的税负率升高，特别是对于一般纳税人而言，不仅会导致所得税升高，还有可能会影响企业的增值税。

当企业出现这种情况的时候，一定要避免的是从不正规的途径购买发票，这样虽然表面上看似降低了企业的税负，但实际上是把企业引入了非常高的税收风险当中。涉及到虚开发票，企业和个人都会受到比较重的处罚，所以一定要避免这样的情况发生，而应该通过正规的途径来改善企业缺少发票的问题。主要可以考虑以下几个方面。

1. 分析缺少发票的原因及占比

一般企业缺少发票的原因可能是几种：

（1）供应商不够规范，没有提供发票的意愿

由于上游的供应商可能很多都是小企业，提供发票的意愿不强，那么可能会导致企业难以获取发票。

（2）企业自身管理薄弱

由于企业没有对发票进行强化管理，所以可能会导致某些环节发票的流失，比如零星物品的采购，员工的差旅等等。

（3）存在特殊的情况

有些企业可能会面对一些特殊的情况，比如建筑工程项目零星采购的泥、沙、砖瓦，或者散户采购的农产品等等。这种情况下，本身发票的获取会有一定的难度。

企业对于这几种情况需要统计各种情况缺少发票的占比。按照重要性原则排序，优先处理对企业影响较大的发票问题。

2. 企业可以考虑的措施

针对不同的问题，企业需要考虑采取不同的措施。

（1）对供应商进行筛选

如果是供应商没有提供发票的意愿，那么企业可以考虑重新选择供应商并且进行税收测算之后进行合理的议价。最好是能够选择那些具有税收优惠政策的企业，这样的企业通常提供发出的意愿会比较高。

（2）改善企业内部的财务管理

对于企业内部财务管理比较薄弱的，需要进行政策制定、相关培训以及不断的强化和监督来改善公司的财务管理状况。当所有员工都有了需要获取发票意识的时候，企业获取发票难的问题也会迎刃而解。

（3）特殊项目的处理

对于特殊的情况，企业需要考虑采取针对性的措施。比如需要采购农产品的尽量考虑到正规的农村合作社进行采购，或者跟散户协商是否能够代开发票。此外，也可以考虑企业自身是否能够取得一些税收优惠，来降低综合的税负。

总的来说，不能获取相应的成本费用发票，会使得企业的税负有所升高，为了降低税负，企业先要分析缺少发票的原因，并采取针对性的措施。从主要的问题开始，各个击破，会使企业缺少发票的现状有所改善。