早在一战期间，皇家海军就已经推出了水下航空母舰，不过，很明显这么另类的玩意儿不会有什么发展前途，难以得到海军高层的支持，最终，英国海军也不过是把一艘潜艇临时改装后，使得其甲板可以用于停放水上飞机。

真正的潜水航母出现在二战期间，二战之前，日本建设了一支强大的水下潜艇部队，不过，与德国海军潜艇部队和美国海军潜艇部队都将破坏敌人的运输线作为打击目标不同，日本海军的潜艇部队是将打击敌人，也就是美国海军的水面战舰作为主要目标的，很明显，要面对全副武装的战舰，加之日本潜艇惊人的噪音和技战术水平的差距，日本海军潜艇部队在二战中损失惨重。不过，其中倒也有些另类产品。

二战前的日本认为：如果能够空袭美国本土，将对美国的士气造成沉重打击。但是当时的日本没有靠近美国的军事基地，空军战机的航程又不够远。因此，决定发展潜水航母，潜行到美国近海，对美国本土进行军事打击。最终，在1942年完成了潜水航母的制造，当年即投入海试，并在后来对美国进行了空袭。这就是世界上唯一的一级潜水航母——伊400（イ-400）级。航程14000海里，续航时间30-48天时间。由于采用了双壳体设计，使他的横截面看上去象一副眼镜，因此有一个别致的绰号“眼镜”。

日本人原本计划使用这种潜艇上搭载的特制飞机靠近日本海岸起飞，向美国国内的森林地区投掷燃烧弹引发山火，或者向人口密集的城市投资细菌炸弹，不过，最终因为种种原因没有投入行动，战后，美军缴获了这艘潜艇，并将其开回了美国研究，最终认为其没有什么价值，将其用于了战后的核武器试验。

近日， 据美国“国家利益”网站报道，美国潜艇界开始讨论将核潜艇改装为能够发射水下无人机（UAV）或无人潜航器（UUV）的潜艇航母，使其能够从远距离打击敌人。美国约翰-霍普金斯大学的研究团队在这方面取得了一定进展，他们制作出一种“创新的无人机（UAV）”，可以在水下部署，并能发射到空中完成各种任务。

军事评论员赵喜说，在冷战期间，苏联海军除了有攻击核潜艇和战略核潜艇之外，还有一种西方海军没有的巡航导弹核潜艇，其搭载的巡航导弹可以使用常规弹头和核弹头攻击敌人。战后，美国海军对这种潜艇十分感兴趣，尤其是在美国海军由于缺乏对手而实行“由海到陆”战略之后，在若干艘俄亥俄级战略核潜艇上做了改装，将原本的潜射洲际导弹发射筒改装为战斧式巡航导弹的发射筒，使得其可以发射巡航导弹用于对地打击。如今，美国提出将核潜艇改装成水下航母，有着异曲同工之妙。不过，这些水下航母发射的将是水下无人机或者无人潜航器，而不是舰载机，与航母存在着很大差别，在未来，随着技术的进步，或许会能够发射载弹量更大的潜射无人机，不过，这种全新模式的武器是否能够成熟并投入实战还需要观察，毕竟，就凭借美国海军现在的实力和预算，完全没有必要去开发这种耗资巨大的新概念武器，而且其具体效果还很不好说。