同治皇帝是慈禧太后的儿子，年仅19岁即驾崩。同治的死因，各书记述不同。

一说是死于慈禧之手。

二说同治得性病死亡，并在同治死后流传颇广。

三说天花死亡

间接被慈禧害死

据御医李德立的曾孙说，同治十三年(1874年)十二月初四日午饭后，阿鲁特皇后来到东暖阁看望同治。慈禧的亲信小太监马上向慈禧报告。慈禧赶到东暖阁后，躲在帏幔后偷听。

皇后毫无觉察，还一个劲地向皇帝哭诉着备受慈禧刁难的痛苦。深有同感的同治帝劝皇后先忍耐一段时间，说等到自己病好之后，皇后总会有出头的日子。慈禧听后，勃然大怒，立刻推幔闯入帷内，劈面一掌，打得皇后血流满面，惨不忍睹。同治大惊，从床上跌落到地上，顿时昏厥过去，从此病势加重，昏迷不醒。

太监急忙传御医进来把脉，但同治已牙关紧闭，滴药不进，到第二天夜晚就去世了。照这种说法，同治虽不是慈禧直接害死的，但也是被她气死的。民间对于同治皇帝的死因有种种说法，清朝官方则保持沉默，不予申辩。因此，同治到底死于什么病，成了一个历史疑案，来揭秘吧将持续关注同治皇帝死因真相。

性病说法

《清朝野史大观》记载道，同治帝在慈禧太后的淫威下，不能与端庄贤静的阿鲁特皇后款洽相亲，而是被强迫与侍郎凤秀的女儿结合，这位后来被立为慧妃的女子虽长得很漂亮，但举止十分轻佻，同治帝并不喜欢她。他因此尽失情爱之乐，于是微服出外寻花问柳，纵情淫乐。

由于清朝的官员是北京城妓院的常客，同治生怕被臣下撞见，不敢出外城，只带了一两个小太监在内城与私窑子中卖淫的女子取乐。当时，还有太监在东华门内开烟馆，藏污纳垢，导男引女，供其取乐。侍读王庆祺又进春药。同治纵情享受，时间一长，就感染上了梅毒，不治而亡。

天花之死

同治皇帝得了天花的记载在官修史书里，而当年十月三十日他的老师翁同稣也在日记中记载了这一说法。同治的病，是“二十一日，西苑着凉，今日发疹”。十一月初二日这天的日记里，有“闻传蟒袍补褂，圣躬有天花之喜”，“昨日治疹，申时，始定为天花也”。十一月初九日的日记中，同治帝召见大臣时，“七色皆盛，头面皆灌浆泡饱满”。并且有“上谕云：‘朕于本月遇有天花之喜，经醇亲王等合词吁请静心调摄。’”除此之外，清宫中的《脉案》也有这样的记载，现代多名医学专家对此进行了研究，进行了认真的分析，得出的结论是：同治皇帝死于天花。

同治皇帝被太医确诊为天花以后，朝廷上下宣布同治之病为“天花之喜”。慈禧太后按照祖上传下来的规矩，在宫内外举行“供送痘神”的活动，两宫太后还亲自前往景山寿皇殿祈求祖先保佑。一时间宫内到处张贴驱邪红联，养心殿供奉上了“痘神娘娘”，王公大臣穿着花衣，按照“前三后四”的说法要穿着七天，但是后来延长为十二天，意思是十二天以后就可以度过危险期。但最终同治皇帝还是没有挺过去，在天花的折磨下不治而亡。