日本《读卖新闻》6月13日报道称，菅义伟在当天上午的记者会上，就中方公布日本自卫队2架f-15战机跟踪中方飞机的视频称，已通过外交渠道向中方提出抗议，要求中方删除相关视频资料。

日本官房长官称：“自卫队战机针对中方飞机采取的‘防止侵犯领空’措施是依据自卫队法进行的，符合国际法，并未对中国飞机的安全飞行带来影响。”

此外，菅义伟再次就中方苏-27战机“异常接近”至日方飞机30米处提出批评，称“中方战机从后方迅速超越日机，且从机头前方做急速横切动作，这是非常规的行为”。

与此同时，日方的欺骗性言论还在日本政府内部蔓延。日本共同社报道称，日本政府高官12日表示，中方主张自卫队f-15战机近距离跟踪中国飞机，就此公开的视频资料“不符实情”。该高官甚至宣称：“这并非记录此次事件的资料，而是毫无关系的其他视频。”另一日本政府相关人士也发表了同样看法，认为“日本和中国的主张哪个正确不言而喻”。

中国国防部发言人耿雁生指出，日方的一系列言行旨在进一步欺骗国际社会，抹黑我国我军形象，制造地区紧张气氛。日方这种恶劣做法罔顾事实，颠倒黑白，纯属恶人先告状。 事实的真相是十分清楚的。6月11日，中国空军航空兵部队在东海防空识别区进行例行巡逻，10时17分至28分，中方图-154飞机在我近海有关空域正常飞行时，遭到日2架f-15飞机抵近跟踪，最近距离约30米，严重影响中方飞行安全。同日上午，日自卫队ys-11eb和op-3侦察机各1架在东海防空识别区内进行侦察活动。根据相关规定，中国空军出动2架歼-11飞机对日机进行了识别查证，与日机距离保持在150米以上。中方飞行员的操作是专业的、规范的，并保持了克制。日方飞行员的做法是危险的，具有明显的挑衅性质。

国防部还指出，长期以来，日方对中方舰机近距离跟踪监视和干扰，危害中方舰机安全，是引发中日海空安全问题的根源。但日方不但没有深刻反省自身错误，反而时常发表不负责任的欺骗煽动言论，对中方恶意攻击，是别有用心的，完全暴露了其在对华关系上的虚伪性和两面性。日方应就此向中方和国际社会作出澄清。中方保留采取进一步措施的权利。