青山黄家与清朝重建海军

后来，清政府重建北洋舰队，黄钟瑛又于光绪二十五年（1899年）重返海军。他先是任“飞鹰”“福靖”舰枪炮官，后历任“海琛”“海筹”等舰船械、驾驶、帮带等职。 光绪三十年（1904年），黄钟瑛提升为“飞鹰”舰管带。光绪三十三年（1907年），黄钟瑛调任“镜清”舰管带兼海军部参谋。不久又调任“海筹”舰管带，授海军副参领。

青山黄家与辛亥革命

1911年武昌起义暴发。清海军统制萨镇冰奉命率长江舰队在武汉江面上，与清陆军合攻革命军。萨镇冰是蒙古族，见广大民众及官兵倾向革命，选择自行引退，临行前指定时任“海筹”舰舰长的黄钟瑛为舰队队长。黄钟瑛本就深感中国内忧外患为腐败清政府所致，只有扫旧布新才有出路，他赞成革命。再经福州同乡、革命党人林森以及李烈钧等人联络动员，他召集下属，鼓励士卒效忠革命。黄钟瑛冒着株连九族的危险，毅然易帜，宣布起义。很快，在他的策动下同行各舰亦相继反正，增长了革命军声威。

海军主力在九江、镇江、上海相继起义后，公推黄钟瑛为临时舰队司令。湖北军政府委托黄钟瑛为海军司令部部长兼“海筹”舰管带。接着，又将起义各舰编为两个舰队，黄钟瑛兼任第一舰队司令，率诸舰驻泊九江。

闻安庆叛乱，黄钟瑛立刻指挥舰队协同九江革命军司令李烈均率队东下，支援安徽革命军。平敌后，又速往镇抚安徽铜陵。紧接着，黄钟瑛率第一舰队赶往南京，进攻张勋部。张勋部惧怕舰炮威力，仓皇北撤，南京宣告独立。

当年11月1日，清军攻入汉口，27日汉阳失守，武昌危急。黎元洪急电黄钟瑛赴援。黄钟瑛立即率舰队兼程溯江北上，力挫清军。不几天，停战议和，各舰队代表在上海选举程璧光为海军总司令，黄钟瑛为海军副总司令。因程璧光在英国未回，由黄钟瑛代理海军总司令。

黄兴在黄钟瑛病逝后，含泪写下挽联，可说是黄钟瑛对辛亥革命贡献的写照：“一举夺得扬子江，汉势不孤，黯收幕南王气；六州齐传奈尔逊，将星忽陨，独存海上雄风。”