二战结束以后，美军就以占领军的姿态在日本驻扎了大量军队，设置了大量军事基地，并拒绝了依照德国模式将日本划分为美占区和苏占区的做法，虽然避免了日后日本像德国一样陷入分裂，但同时也更加强化了美军的占领军地位，美军在日本国内享有特殊待遇。

美军在日本驻军，一部分原因是监督日本战后完成民主化，防止日本军国主义势力死灰复燃，另一方面，则是出于冷战的需要，将日本建设成为在远东地区对抗苏联的桥头堡，不仅在日本驻扎了大量的海陆空军，甚至在日本部署了战术核武器。即便是冷战结束后的今天，美军将核武器撤出了日本，并将大部分驻军搬迁到冲绳，留在日本本土的主要是一些海空军基地。

至于驻日美军的相关费用，根据1960年的《日美地位协定》，日方并没有支付驻日美军经费的义务，日本向驻日美军提供的支持仅限于“设施和场地”。但是在20世纪70年代，情况发生了变化，由于越战的影响，特别是1973年国际油价上涨，整个西方世界面临经济发展滞涨的困难局面，美国军事拨款有所不足，同时，苏联在勃列日涅夫的领导下，依靠大量出口能源原材料，积极发展军备，一时间，冷战格局出现了“苏攻美守”的局面，美国在执行“战略收缩”的同时，也要求自己的盟友，不论是欧洲的还是亚洲的盟友，不要讲所有的安全重担都压在美军身上，也要肩负起自己的义务，为美军减轻压力。由此，美国不但要求日本积极发展军力，也正是在这个时候，随着日本经济走强，美国开始向日本施压，要求其提供更多经费支持。

据外媒报道，日本外相岸田文雄和美国驻日本大使卡罗琳·肯尼迪就日方负担的驻日美军经费签署新的特别协定。根据这一协定，日本在2016年4月起的下一个五年为驻日美军负担总额9465亿日元（约合80.5亿美元）经费，比上一个五年增加133亿日元（1.1亿美元）。美军将在装备维持与整修上投入更多资金。与之相应，日方将增加相关工作人员的劳务费用负担。

日本政府先前以安全保障相关法通过后将强化对美支援以及财政严峻为由，要求大幅削减其负担的驻日美军经费。然而，美方表示，美国将向美海军横须贺基地部署两艘最新型宙斯盾军舰，并将增强在日活动，需要更多资金支持。共同社称，经费最终敲定“微涨”，是日方妥协。

军事评论员赵喜认为：自冷战结束以后，来自北方的压力骤然消失，日本国内的独立情绪日渐加深，要求摆脱美国的占领状态，日本要成为一个真正的现代国家，而非是美军控制下的“占领国”，为此，日本政府一方面通过各种手段要求美国放松对日本的束缚，另一方面，日本民众也屡次示威游行，尤以冲绳民众为甚，频频在普天间基地外围示威。

日本政府此前试图通过削减支付给驻日美军的经费为手段，逼迫美国减少驻日美军的数量，但一方面受限于美国的强硬态度，美国不希望由于减少驻日美军的数量而减弱对日本的控制，另一方面，近年来日本的安全局势受到了几乎全方位的挑战：俄罗斯的战略轰炸机不是围绕日本列岛飞行，至于战术飞机的入侵领空几乎每日都有；中日之间在相关地区的争议依旧存在；朝鲜在发展核武器与导弹的时候，很明确的将驻日美军基地列入打击目标，根据其导弹精度和核武器的巨大威力，日本不受其威胁几乎是不可能的；尽管在美国的协调下，韩国与日本的关系近年来有所缓和，不过韩国国内的反日情绪高涨，围绕慰安夫与教科书等问题的争执几乎从未停止，更不要说独岛等领土问题了。事实上，按照目前日本的军力，尤其是日本民众的反战情绪看，仅仅依靠自卫队，难以保证日本本身的安全。同时，驻日美军的存在，在很大程度上也担负起了保护日本的责任，用有限的资金就可以节省扩大自卫队规模带来的经济与舆论压力，事实上是比较划算的，这也是为什么欧洲各国拒绝美军撤销在所在国基地的原因之一。