蛹内的穆托，一直以来有与外界周期性沟通的迹象，但不知作用为何。然而此时穆托发出的频率越来越频繁，芹泽只好启动电网，意图杀死穆托，然而失败。穆托发动电磁脉冲瘫痪了研究所内的电子设备，乔和福特也趁此机会顺利逃离。但在此时穆托破茧而出，毁坏了大半的研究所，混乱当中乔从高处摔下，送院途中不治身亡。而穆托则朝着太平洋另一端振翅而去。

　　发现怪兽出没的美国军方，早已在太平洋周边进行防御部署。芹泽告知军方：以穆托的破坏力，人类的武器无法与之抗衡。恰巧因穆托与外界沟通期间，亦侦测到哥斯拉苏醒的回应，芹泽大胆推断人类需借助哥斯拉的威力来消灭穆托。然而美军指挥官担心会伤及无辜，表示不予认同。

　　在父亲身亡后，才了解其所言属实的福特，也担心怪兽会对家人造成伤害，欲向军方贡献己力，借此顺道返回美国。而后美军以监督护卫的方式，跟随哥斯拉经过了遭穆托肆虐的夏威夷而到达美国本土内华达州;原来亦有一只雌性穆托潜伏在美国内陆，以赌城附近的核废料场为生，与在日本的雄性穆托经过沟通联络上后，欲在旧金山会合而达到繁殖的目的。哥斯拉则侦测到穆托们的沟通而展开追击，以维持自然界的平衡。