此时雌穆托打算摄取已被运到港口边的核弹内部辐射，并将反抗的军人们杀死。福特趁着雌穆托被其他军人吸引之际，把放置核弹的船开往海上，但却再度被雌穆托给盯上。就在福特举起手枪打算做最后的抵抗时，雌穆托被再次出现的哥斯拉射入原子吐息。雌穆托在原子吐息的高温下被融断了脖子，哥斯拉将雌穆托的头部扔入海中，朝着天空发出胜利的吼叫，之后缓缓倒下。随后失去意识的福特被救援队带离船上，并在朦胧中看到运出海外的核弹引爆。 之后福特和他妻儿团聚，而本以为死去的哥斯拉却再度醒来，对着天空吼叫后，再次返回到大海。