由于碑文中“硕甫”二字风化严重，字迹模糊，有专家对此提出异议。刘凤云表示，这个在马家寨的吴三桂墓地，有可能是后人用他的衣冠后来做的墓。因为吴三桂是死在湖南的，将其送到昆明、再送到贵州，这是不可能的。因此，学界对墓主是否是吴三桂还需要进一步考证。

　　李治亭称，目前依然有学者存在质疑，如马家寨的人是不是吴三桂的后裔?吴家的口述历史可信吗?吴应麟是吴三桂的儿子吗?吴三桂葬在马家寨的论据不充分，特别是对墓碑文的解读，目前争议也很大。他强调，史学研究应该加强对口述历史的认识，无论是文字与口述，都是历史记述，都应同等对待。两者互补，两者互证，又可纠正一方之不足，同时要将社会调查与历史记载相结合。

　　刘凤云对全凭口述史来作判断表示不认可，她强调历史研究方法应该是口述史与实证材料相结合。

　　目前关于吴三桂、陈圆圆史迹的具体研究还存有疑问，但专家表示，运用历史文字记载与口述及实物的“三重论”研究方法，将深化历史研究、揭示事实真相。